Na segunda ronda do sorteio juntaram-se aos participantes da 1.ª eliminatória, as equipas da Liga Portugal Sabseg 2, no total de 92 emblemas (16 da II Liga, 20 da Liga 3, 38 do Campeonato de Portugal e 18 oriundos das provas distritais).
O Sport Clube Vianense e o Sporting Clube Courense, os dois emblemas do distrito de Viana do Castelo presentes neste sorteio, ficaram a conhecer os seus adversário.
O Vianense desloca-se a Portalegre para defrontar o Sport Arronches e Benfica da Serie C do Campeonato de Portugal, já o Courense desloca-se ao Sul do País para defrontar o Silves Futebol Clube que joga nos campeonatos distritais da Associação de Futebol do Algarve.
No sorteio desta segunda eliminatória, já entraram os 16 clubes da II Liga.
Os 18 emblemas da I Liga só entram na terceira eliminatória.